V 2. polovině 17. století se vzpomínají na Špitálním mlýně mlynáři Jiří Streitl a Jan Muttwill.
Později se na mlýně připomíná Jan Straka, který roku 1687 mlýn prodal za 500 tolarů slezských Kristiánu Leopoldu Muttwillovi, synu bývalého špitálního mlynáře Jana Muttwilla, jenž ale v r. 1697 zemřel. Mlynář odváděl svatojánské komendě 1 šefl pšenice a 2 maldry žita a měl vykrmit 2 vepře, za to vrchnost poskytuje dřevo na stavbu a údržbu splavu a 2 kmeny na opravy zařízení mlýna z vrchnostenských lesů. Prostřednictvím robotníků zajišťuje dopravu dřeva a mlecích kamenů a jednou ročně čištění mlýnského příkopu.
Někdy v té době Špitálský mlýn zcela vyhořel - v listině z 2. července 1699 se píše o "požárem zcela zničeném hospitálním mlýně, ležícím za knížecím dvorem na půdě komendy sv. Jana".
Po smrti Kristiána Leopolda Muttwilla připadl mlýn podle testamentu vdově Kateřině, která jej později převedla na svého druhého muže, Kristiána Floriána z Ehrenkronu, nájemce svatojánské komendy. Ten nechal mlýn pravděpodobně znovu vystavět a přistavět k němu třetí složení. Problémy s nedostatkem vody vyřešil nový majitel tak, že nechal postavit nový vyšší stav. Na jaře 1714 se strhla velká povodeň, která poškodila nejen tento stav, ale zničila i více než sto usedlostí. Protože vina za tuto povodeň byla dávána stavu u Špitálského mlýna, strhla se kolem jeho obnovy "mlýnská vojna". Spory mezi majitelem mlýna a magistrátem se táhly až do roku 1716. Bohužel nevíme, jak tato "vojna" skončila, ale stav u špitálského mlýna byl zrušen až na začátku 20. století při regulaci řeky Opavy.
Z mlynářů, kteří na mlýně mleli, se zmiňuje k r. 1782 Jan Smolka.
V roce 1830 měl špitální mlýn tři složení a jeho majitel Josef Herold jej nechal zcela přebudovat.